茱蒂絲‧湯姆森的主要哲學研究範圍是倫理學和形上學，她最知名的哲學貢獻是在墮胎與隱私權方面的討論。她在〈殺戮、放任死亡和電車難題〉(Killing, Letting Die, and the Trolley Problem, 1976) ，將芙特所提出的電車思想實驗命名為「電車難題」，促成了後續的相關討論。而湯姆森提出的小提琴家的思想實驗，區別了生命權和生命維護權，她的假設將哲學注意力從胎兒的權利轉向了孕婦的權利，深刻影響了後續的墮胎議題討論。

在倫理理論方面，湯姆森反對結果論、享樂主義和主觀主義觀點，她也討論了關於行動和事件之間的關係。此外，她在隱私與隱私權方面的哲學討論也做出了重大貢獻。